生化標(biāo)記是指生物的生化特征特性，主要包括同工酶和儲藏蛋白兩種標(biāo)記。同工酶是指同一種功能相同但結(jié)構(gòu)不同的一組酶，它是由不同基因位點(diǎn)或等位基因編碼的多肽鏈單體、純聚體或雜聚體。同工酶是生物題代謝的調(diào)節(jié)者，與特殊的生理指標(biāo)功能和細(xì)胞分化相聯(lián)系，也與基因進(jìn)化和物種的演變有關(guān)，因此，同工酶既可作為生理指標(biāo)又可作為遺傳標(biāo)記在生物群體的遺傳進(jìn)化和分類研究中廣為應(yīng)用。另外，同工酶研究也有助于探討生物個(gè)體發(fā)育過程中基因的表達(dá)與控制。生化標(biāo)記具有簡便、經(jīng)濟(jì)、快速和準(zhǔn)確等優(yōu)點(diǎn)，但同樣具有標(biāo)記數(shù)目有限的缺點(diǎn)。儲藏蛋白與種子的萌發(fā)等發(fā)育過程有關(guān)，也具有生物種屬的特異性，可以作為遺傳標(biāo)記。例如，馬鈴薯蛋白是馬鈴薯塊莖中的主要蛋白（儲藏蛋白）；玉米醇溶蛋白是玉米種子內(nèi)的儲藏蛋白，按其結(jié)構(gòu)和溶解度分為A、B、C和D四大類。雖然其他生物中無該儲藏蛋白，但有其特異的儲藏蛋白。