QIAGEN法和IQ法在蛋白酶K消化法的基礎(chǔ)上均增加了用硅基質(zhì)作為材料的DNA純化步驟，因此均可以獲得純度較高的模板DNA，但對(duì)于甲醛固定石蠟包埋組織來(lái)說(shuō)，二者的回收率有差別，QIAGEN法采用的是硅膠膜層析過(guò)濾技術(shù)，可以去除部分降解形成的寡核苷酸碎片，DNA大片段“有效”模板的回收率相對(duì)較高；IQ法采用硅珠吸附洗脫技術(shù)，獲得的DNA量與所用磁珠的數(shù)量和吸附力有關(guān)，而體系中一定量的硅珠優(yōu)先吸附含量豐富的小片段DNA，故在樣品負(fù)載大的情況下有效，即使加大硅珠用量，DNA大片段“有效”模板的回收率也并不能顯著提高。Chelex-100法是一種由聚乙烯乙二烯苯組成的螯合基團(tuán)，能螯合福爾馬林固定石蠟包埋( FFPE)組織在高溫裂解后釋放的內(nèi)源性二價(jià)金屬離子，如Mg2+上、Ca2+等，從而阻止其在高溫下斷裂DNA的作用，該法簡(jiǎn)單廉價(jià)，一管到底，一步完成，能有效地降低福爾馬林固定石蠟包埋(FFPE)組織模板DNA的損失和外源性污染的發(fā)生，俚因所提取DNA模板的純度不高，并不能明顯改善PCR擴(kuò)增效果。