平板電泳在法醫(yī)DNA分析應(yīng)用中已有30多年的歷史，并被證明為一種有效的分型技術(shù)，但是近10年來，越來越多的實驗室已經(jīng)放棄了該技術(shù)。作為一種曾經(jīng)占有重要歷史地位的技術(shù)，北京科鑒基因親子鑒定中心將對此進行簡要介紹。
      平板電泳采用的是平板凝膠。平板凝膠由包含許多小孔的固態(tài)介質(zhì)和緩沖液組成，DNA分子的電泳過程是在凝膠中移動。凝膠成分混勻后倒入確定平板凝膠形狀的模具中。凝膠的一端插入樣本梳，在凝膠凝固后拔掉樣本梳，樣本梳的齒會在凝膠上留下一些小孔，用來加入DNA樣本。
      目前在法醫(yī)DNA實驗室用于DNA分離的凝膠主要有兩種：瓊脂糖凝膠和聚丙烯酰胺凝膠。前者因有較大的孔徑常用于分離600～23 000bp的較大片段的DNA分子，后者則通常用于高效分離低于500bp的小片段DNA。限制性片段長度多態(tài)性( RFLP)方法就是使用瓊脂糖凝膠方法來分離片段的。由于商業(yè)化STR分型試劑盒的擴增片段常為100～400bp，瓊脂糖凝膠不能很好地分離，而用聚丙烯酰胺凝膠則可以獲得較好的分離效果。
      正常條件下，DNA互補的雙鏈彼此結(jié)合在一起。對互補的雙鏈DNA進行分離的電泳稱為非變性凝胺電泳，而使DNA保持單鏈狀態(tài)進行分離的電泳則為變性凝膠電泳。一般來講，變性系統(tǒng)能更好地解決長度相似的DNA分子分離的問題，這是因為單鏈DNA比雙鏈DNA有更大的柔韌性，因此可以更有效地與凝膠的分子篩相互作用，從而達到更好的分離目的。自然狀態(tài)下的DNA分子經(jīng)常會形成空間二級結(jié)構(gòu)，這一點在變性凝膠系統(tǒng)中也可以避免。為了得到變性系統(tǒng)，常使用一些化學(xué)物質(zhì)（如甲酰胺和尿素），它們可與DNA的堿基形成氫鍵，從而阻止互補鏈的形成。此外，提高分離的溫度和溶液的pH也有助于保持DNA的單鏈狀態(tài)。