我們可以通過幾個要點判斷是否為混合樣本。以下問題的解答能幫助我們確定混合樣本各組分的基因型:
1 是否有基因座在預期的等位基因長度范圍內(nèi)有兩個以上的峰形存在?
2 是否在一個基因座存在雜合子等位基因峰高的明顯不平衡?
3 stutter蜂的高度是否過高(如大于15%—20%)?
如果以上任何一個問題的答案為“是”,DNA分型結(jié)果很可能來自一個混合樣本o FSS已經(jīng)很深入地討論過混合樣本的結(jié)果解釋( Clayton et a1.,1998;Gill et a1.,1998)。
通常一個樣本因為在一個或多個基因座存在3個或3個以上的峰而首先被確定為混合物。由于下列可能的基因組合,來自兩個不同個體的混合樣本在一個基因座可能出現(xiàn)1個、2個、3個或4個峰形,分別如下:
(1)4個峰形
雜合體+雜合體,不存在重疊的等位基因(基因型是惟一的)。
(2)3個峰形
雜合體+雜合體,存在一個重疊的等位基因。
雜合體+純合體,不存在重疊的等位基因(基因型是惟一的)。
(3)2個峰形
雜合體+雜合體,存在兩個重疊的等位基因(可以認定基因型)。
雜合體+純合體,存在一個重疊的等位基因。
純合體+純合體,不存在重疊的等位基因(基因型是惟一的)。
(4)1個峰形
純合體+純合體,重疊的等位基因(基因型相同)a
當組成混合樣本的兩個個體共有一個或多個等位基因時,這些等位基因會被掩蓋,每個個體的基因型就很難讀出。比如,兩個個體在FGA基因座的基因型分別為23、24和24、24,兩者DNA混合比例為1:1時,23、24等位基因的峰面積比例應(yīng)為1:3。在這一特例中,如果沒有更多的信息,混合樣本結(jié)果就可以解釋為一個純合體等位基因和一個stutter峰。但通過分析其他沒有共享等位基因的STR基因座分型結(jié)果,如每個基因座存在3個或4個峰形,這個樣本就能夠準確地區(qū)分出不同的組分。
為了觀察混合樣本是否在一個多基因座體系的每個基因座都會發(fā)生等位基因的掩蓋,F(xiàn)SS利用白人數(shù)據(jù)庫中120 000個個體的STR分型結(jié)果進行了一次模擬混合樣本研究(Cill et a1.,1997)。他們發(fā)現(xiàn),在6個STR基因座上,絕大多數(shù)人工合成的混合樣本均出現(xiàn)了15~ 22個峰形。兩個雜合子個體若在6個基因座上沒有重疊等位基因,所組成的混合樣本最多出現(xiàn)24個峰形。因此,無關(guān)個體組成的簡單混合樣本可通過幾個基因座存在3個或更多峰形來確認。超過212 000個組合中,只有4個組合在6個基因座上僅出現(xiàn)1個或2個等位基因,他們可因存在峰形的不均衡而判斷出為混合樣本(Cill et a1.,1997)。
北京科鑒親子鑒定中心多次成功檢測男女混合樣本,羊水混合樣本。并明確得到親子鑒定結(jié)果。
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