1)經(jīng)DNA檢測(cè)（系統(tǒng)的累計(jì)非父排除率在99.99%以上），發(fā)現(xiàn)各基因座符合相應(yīng)的遺傳定律，2000
2)經(jīng)常染色體DNA檢測(cè)（系統(tǒng)的累計(jì)非父排除率在99.99%以上），發(fā)現(xiàn)1~2個(gè)基因座不符合相應(yīng)的遺傳定律（考慮存在突變），這種情形下，應(yīng)增加檢測(cè)其它的高度多態(tài)性且遺傳穩(wěn)定的STR基因座；若被檢驗(yàn)的孩子為女孩，應(yīng)盡可能對(duì)被檢父母與女孩增加檢測(cè) X-STR；若被檢驗(yàn)的孩子為男孩，且被檢父與孩子可能的生父不屬同一父系，應(yīng)盡可能對(duì)被檢父與男孩增加Y-STR的檢驗(yàn)。將突變基因座寫(xiě)入報(bào)告書(shū)中，并按突變基因座PI值的計(jì)算方法（見(jiàn)備注）計(jì)算PI和CPI值。計(jì)算后若發(fā)現(xiàn)CPI≤0.0001，則據(jù)此排除親權(quán)關(guān)系；若0.0001＜CPI＜10000，則不排除親權(quán)關(guān)系。
備注1：若三聯(lián)體中存在不符合遺傳規(guī)律的常染色體遺傳標(biāo)記，如孩子的表型為PQ，被檢測(cè)男子表型為P'R，其中P'比P 小或大1個(gè)或2個(gè)重復(fù)單位（s=1或2），μ為該基因座平均突變率，p為等位基因P的頻率，親權(quán)指數(shù)計(jì)算方法為：
突變?yōu)?span lang="EN-US">1步(s=1), 則: PI =X/Y = μ/(4p)
突變?yōu)?span lang="EN-US">2步(s=2), 則: PI =X/Y = μ/(40p)
突變?yōu)?span lang="EN-US">3步(s=3), 則: PI =X/Y = μ/(400p)
余此類推（見(jiàn)表6）
表6 三聯(lián)體中存在不符合遺傳規(guī)律的遺傳標(biāo)記時(shí)親權(quán)指數(shù)計(jì)算實(shí)例
(以D7S820為例，平均突變率μ為0.002 )
|
基因座 |
孩子生母 |
孩子 |
被檢測(cè)父親 |
親權(quán)指數(shù) |
|
D7S820 |
7 |
7-8 |
9-11 |
μ/(4P8) |
|
D7S820 |
7 |
7-8 |
10-11 |
μ/(40P8) |
|
D7S820 |
7 |
7-8 |
11-12 |
μ/(400P8) |
|
D7S820 |
7 |
7-8 |
9 |
μ/(2P8) |
|
D7S820 |
7-8 |
8 |
9 |
μ/(2P8) |
|
D7S820 |
7-8 |
8 |
7-9 |
2μ/(4P8) |
|
D7S820 |
7-8 |
8 |
9-11 |
μ/(4P8) |
|
D7S820 |
7-9 |
7-9 |
10-11 |
μ/[4(P7 + P9)] |
|
D7S820 |
7-9 |
7-9 |
10 |
μ/[2(P7 + P9)] |
|
D7S820 |
7-9 |
7-9 |
8-10 |
3μ/[4(P7 + P9)] |
|
D7S820 |
7-8 |
7-9 |
7-8 |
μ(1+1/3.5)/(4P9) |
|
D7S820 |
9 |
7-8 |
7 |
μ /(2×3.5×P8) |
注：表中P7、P8、P9為相應(yīng)等位基因7、8、9的頻率
備注2：若二聯(lián)體中存在不符合遺傳規(guī)律的常染色體遺傳標(biāo)記，如孩子的表型為PQ，被檢測(cè)男子表型為P'R，其中P'比P 小或大1個(gè)或2個(gè)重復(fù)單位（s=1或2），μ為該基因座平均突變率，p為等位基因P的頻率，則親權(quán)指數(shù)計(jì)算方法為：
突變?yōu)?span lang="EN-US">1步(s=1)，則: PI =X/Y = μ/(8p)
突變?yōu)?span lang="EN-US">2步(s=2)，則: PI =X/Y = μ/(80p)
突變?yōu)?span lang="EN-US">3步(s=3)，則: PI =X/Y = μ/(800p)
余此類推（見(jiàn)表7）
表7 二聯(lián)體中存在不符合遺傳規(guī)律的遺傳標(biāo)記時(shí)親權(quán)指數(shù)計(jì)算實(shí)例
(以D7S820為例，平均突變率μ為0.002 )
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基因座 |
孩子 |
被檢測(cè)男子 |
親權(quán)指數(shù) |
|
D7S820 |
7-8 |
9-11 |
μ/(8P8) |
|
D7S820 |
7-8 |
10-11 |
μ/(80P8) |
|
D7S820 |
7-8 |
11-12 |
μ/(800P8) |
|
D7S820 |
7-8 |
9 |
μ/(4P8) |
|
D7S820 |
8 |
9 |
μ/(2P8) |
|
D7S820 |
8 |
7-9 |
2μ/(4P8) |
|
D7S820 |
8 |
9-11 |
μ/(4P8) |
|
D7S820 |
7-9 |
8-10 |
μ(2P7+P9)/(8P7P9) |
|
D7S820 |
7-9 |
8 |
μ(P7+P9)/(4P7P9) |
注：表中P7、P8、P9為相應(yīng)等位基因7、8、9的頻率
3) 若被檢父與可能的生父存在特殊的血緣關(guān)系（如父子關(guān)系、叔侄關(guān)系、同胞兄弟關(guān)系等），在可能的情況下，應(yīng)同時(shí)提取孩子生母和其他的可疑父親的樣本進(jìn)行檢驗(yàn)。
4) 在祖孫關(guān)系鑒定中，經(jīng)常染色體DNA檢測(cè)（系統(tǒng)的累計(jì)非父排除率在99.99%以上），若發(fā)現(xiàn)1～2個(gè)基因座不符合相應(yīng)的遺傳定律（考慮存在突變），應(yīng)增加檢測(cè)其它的高度多態(tài)性且遺傳穩(wěn)定的STR基因座；若被檢驗(yàn)的孩子為女孩，應(yīng)盡可能對(duì)被檢祖母與孫女增加X-STR的檢驗(yàn)；若被檢驗(yàn)的孩子為男孩，應(yīng)盡可能對(duì)被檢祖父與孫子增加Y-STR的檢驗(yàn)。若仍然只有原來(lái)的基因座不符合遺傳規(guī)律，則將這些基因座當(dāng)作突變基因座處理，寫(xiě)入報(bào)告書(shū)中，出具“不排除存在生物學(xué)祖孫關(guān)系”的鑒定意見(jiàn)。
