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植物物種鑒定

植物物種鑒定

通過DNA barcoding 技術分析RBCLMATK基因,可對植物進行物種水平的鑒定。特定的法醫(yī)應用中,則需輔助特異遺傳標記,進一步地進行分析。該技術適用單一種屬來源樣本的分析。

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北京科鑒基因中心

北京科鑒基因中心

等級: [專業(yè)機構]

評價: 4.9分

中心公告:結果客觀真實反應??商峁┥祥T采集樣本服務,接收國內(nèi)外郵寄樣本(僅限個人鑒定)。同時提供STR分型檢測技術培訓和解決方案。

溫馨提示: 周六日提前一天預約,安排值班接待辦理。

中心地址:北京市海淀區(qū)

辦理時間:周一到周日:9:00-17:00(周六日提前一天預約)

  • 項目詳情
  • 鑒定須知
  • 交通位置
  • 平臺信息
  • 中心點評(11)
  • 立即預約

項目用途:??確認單一植物物種

項目規(guī)格:??DNA barcoding 技術分析RBCL&MATK基因

檢測周期:??5-7個工作日。

辦理方式:??郵寄樣本,上門取樣。

樣本類型:??葉片、種子、DNA

樣本要求:??未高溫處理過

      通過DNA barcoding 技術分析RBCL&MATK基因,可對植物進行物種水平的鑒定。特定的法醫(yī)應用中,則需輔助特異遺傳標記,進一步地進行分析。該技術適用單一種屬來源樣本的分析,若樣本為多物種混合來源,則采用我公司的CELL STR ID技術進行分析。

NCBI數(shù)據(jù)庫物種比對確認步驟
使用NCBI數(shù)據(jù)庫確認物種通常涉及序列比對和物種鑒定。以下是詳細步驟指南:
 
一、使用BLAST進行序列比對確認物種
訪問NCBI BLAST
打開NCBI網(wǎng)站 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)
點擊"BLAST"工具或直接訪問 https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/
選擇適當?shù)腂LAST程序
核苷酸序列: 選擇"nucleotide BLAST" (blastn)
蛋白質序列: 選擇"protein BLAST" (blastp)
對于未知類型的序列,可選擇"blastx"或"tblastn"
輸入查詢序列
在查詢框中粘貼FASTA格式的序列
或上傳包含序列的文件
設置數(shù)據(jù)庫和參數(shù)
數(shù)據(jù)庫選擇:
核苷酸: "nr/nt" (非冗余核苷酸數(shù)據(jù)庫)
蛋白質: "nr" (非冗余蛋白質數(shù)據(jù)庫)
限制物種范圍(可選): 在"Organism"框中輸入已知或懷疑的物種名稱
其他參數(shù)通??墒褂媚J值
運行BLAST
點擊"BLAST"按鈕提交任務
分析結果
查看"Descriptions"選項卡中的匹配結果
重點關注:
E-value (越小越好,通常<0.001)
Query cover (覆蓋度,越高越好)
Percent identity (相似度,越高越好)
檢查匹配物種的學名和共同信息
 
二、使用NCBI Taxonomy確認物種分類
訪問NCBI Taxonomy數(shù)據(jù)庫
直接訪問 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/taxonomy
搜索物種
在搜索框中輸入物種名稱(學名或俗名)
或輸入Taxonomy ID (如果已知)
查看分類信息
確認完整的分類等級(界、門、綱、目、科、屬、種)
檢查同義詞和常見名稱
查看相關序列和出版物
 
三、使用其他NCBI工具確認物種
NCBI Nucleotide/Protein數(shù)據(jù)庫
搜索已知的物種特異性標記基因(如16S rRNA、COI等)
比較查詢序列與已知物種標記的相似性
NCBI Genome數(shù)據(jù)庫
對于全基因組或大片段,可比較與參考基因組的相似性
訪問 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/
 
四、多序列比對確認(更精確的方法)
下載多個相關物種的同源序列
使用Clustal Omega、MAFFT等工具進行多序列比對
構建系統(tǒng)發(fā)育樹(MEGA、PhyML等工具)
通過進化關系確認物種分類地位
 
注意事項
對于微生物,16S rRNA基因比對是常用方法,但可能分辨率有限
對于高等生物,可考慮使用多個標記基因聯(lián)合分析
相似度閾值參考:
16S rRNA: >97%通常視為同一物種
COI基因: >98%通常視為同一物種
結合形態(tài)學、生態(tài)學等其他證據(jù)進行綜合判斷
通過以上步驟,您可以在NCBI數(shù)據(jù)庫中有效地比對序列并確認物種分類信息。
平臺信息

北京司法鑒定平臺

北京司法鑒定平臺是是遵照中華人民共和國司法部頒布的鑒定機構管理辦法,經(jīng)北京司法局核準登記的專業(yè)司法鑒定機構。

北京司法鑒定平臺業(yè)務

鑒定領域:司法親子鑒定、個人親子鑒定、移民親子鑒定、落戶親子鑒定、胎兒親子鑒定、親緣關系鑒定、DNA身份識別、線粒體DNA檢測、基因身份證、DNA尋親覓祖及種屬鑒定等鑒定項目。

北京科研技術平臺

北京科研技術平臺是國內(nèi)早期一批從事DNA檢測研究的平臺。其STR分型檢測技術較早應用親子鑒定和細胞鑒定,領銜建設協(xié)助國內(nèi)多家DNA實驗建設和人員培訓,向行業(yè)輸送大量的DNA檢測研發(fā)工作者。同時開發(fā)了基因檢測行業(yè)新的多種產(chǎn)品,為STR分型檢測行業(yè)貢獻力量。在親子鑒定和細胞鑒定上有著延續(xù)十多年的經(jīng)驗,同時產(chǎn)前無創(chuàng)親子鑒定技術,有著較高的質量控制標準。

北京科研技術平臺業(yè)務

鑒定領域:個人親子鑒定、產(chǎn)前無創(chuàng)親子鑒定、個體識別、人源細胞STR鑒定、小鼠細胞STR鑒定、種屬鑒定、猴源細胞鑒定、倉鼠細胞鑒定、大鼠細胞鑒定、HLA分型、支原體檢測(PCR法+恒溫法)、核型分析(NGS技術)、精斑血斑確認。

中心點評(11)

4.8

專業(yè)水平:4.9分服務水平:4.9分位置環(huán)境:4.8分

全部(20) 交通便利(6) 服務熱情(5) 法醫(yī)專業(yè)(5) 解讀清晰(3) 還會再來(1)

  • 相關項目
  • DNA中心
  • 全國3000多家

    服務預約檢測人次

  • 機構

    司法機構官方授權預約合作方

  • 預約辦理

    檢測快速處理

  • DNA檢測預約指導

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