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北京科鑒基因-Chelex-100法提取生物檢材中的DNA

一、 原理
  當(dāng)檢材較少時(shí)或者基因分型只需要少量的DNA時(shí),可以用Chelex-100提取方法提取DNA。Chelex-100是一種化學(xué)整合樹(shù)脂,由苯乙烯、二乙烯苯共聚體組成。含有成對(duì)的亞氨基二乙酸鹽離子,整合多價(jià)金屬離子,尤其是選擇性整合二價(jià)離子,比普通離子交換劑具有更高的金屬離子選擇性和較強(qiáng)的結(jié)合力.能結(jié)合許多可能影響一步分析的其他外源物質(zhì)。通過(guò)離心除去Chelex-100顆粒,使這些與Chelex-100結(jié)合的物質(zhì)與DNA分離,防止結(jié)合到Chelex中的抑制劑或雜質(zhì)帶到PCR反應(yīng)中,影響下一步的DNA分析,并通過(guò)結(jié)合金屬離子,防止DNA降解。

二、實(shí)驗(yàn)?zāi)康?br />   掌握各種法醫(yī)學(xué)生物檢材DNA提取方法。
三、儀器設(shè)備
  干熱器、恒溫水浴箱、高速離心機(jī)、離心管
四、試劑
  Chelex-100法提取生物檢材所需試劑的配制
  1. 5% Chelex-100 (w/v)
  稱(chēng)取5克Chelex-100,加100ml滅菌純水,放4℃保存。
  2. 10% SDS
  稱(chēng)取10克優(yōu)級(jí)純的SDS,加純水到100ml溶解,室溫保存。
  3. 5mg/ml PK酶(蛋白酶K)
  稱(chēng)取5mg PK酶,溶于1ml滅菌純水中,-20℃保存。
  4. 1M DTT (二硫蘇糖醇)
  稱(chēng)取154.3mg DTT加1ml滅菌純水溶解,-20℃保存。
五、 實(shí)驗(yàn)方法---Chelex-100法
  1. 全血
  1) 取3~10μl全血加到0.5ml離心管中,加人500μl純水,劇烈振蕩,室溫下放置15分鐘。
  2) 13,000rpm離心3分鐘,去上清,收集沉淀。(必要時(shí)可用蒸餾水反復(fù)洗沉淀物,直至無(wú)色或血色素很少)。
  3) 沉淀中加入200μl 5% Chelex-100溶液(5% Chelex-100為懸濁液,使用前要充分振搖,使Chelex-100顆粒懸?。?,在振蕩器上反復(fù)振蕩,放入56℃保溫30分鐘以上。
  4) 取出后振蕩,100℃保溫8分鐘,振蕩后,13,000rpm離心3分鐘,上清用于PCR擴(kuò)增,或放4℃保存?zhèn)溆谩?br />   2. 血斑
  1) 剪取約0.5cm2的血斑,加到0.5ml的離心管中,加入500μl純水,劇烈振蕩,室溫放置15分鐘。13,000離心3分鐘,去上清。(可用純水反復(fù)洗至無(wú)色,載體不需去除,始終留在離心管中。)
  2) 以下步驟同全血的提取方法。
  3. 混合斑
  1) 取適量含有混合斑的檢測(cè),剪碎后放入5ml小燒杯中,加入3ml純水、300μl 10% SDS及150μl 5mg/ml 的PK酶,用牙簽攪拌后,放入37℃水浴6小時(shí)以上(最好過(guò)夜)。
  2) 將水浴好的檢材移入1.5ml離心管(檢材載體用一次性注射器擠壓后去除),13,000rpm 離心3分鐘,去上清,每管加1.4ml 純水,振蕩,13000rpm 離心3分鐘。洗三次后,移入0.5ml離心管中,13000rpm離心3分鐘,棄上清。
  3) 向沉淀物的離心管中加入200μl 5%的Chelex-100(可根據(jù)檢材量的多少進(jìn)行調(diào)節(jié)),4μl 5mg/ml 的PK酶及8μl 1M的DTT(PK酶及DTT的終濃度分別為100μg/ml和0.039M),振蕩后56℃保溫過(guò)夜。次日取出振蕩,100℃保溫8分鐘,振蕩,13000rpm離心3分鐘,上清用于PCR擴(kuò)增或放4℃保存?zhèn)溆谩?br />   4. 含有唾液斑的檢材
  1) 唾液斑:處理方法與血斑的處理方法相同。
  2) 煙頭: 用鑷子夾住煙頭,剪刀剪下煙頭外圈的紙,剪碎后放入0.5ml離心管中,加人500μl純水,劇烈振蕩,13000rpm離心3分鐘,棄上清,加入100μl 5% 的Chelex-100,放入56℃保溫30分鐘以上。取出振蕩,100℃保溫8分鐘,13000rpm離心3分鐘,上清用于PCR擴(kuò)增或放4℃保存?zhèn)溆谩?br />   3) 口香糖:將口香糖剪碎后放入0.5ml離心管中,加人500μl純水,劇烈振蕩,13000rpm離心3分鐘,棄上清,加入100μl 5% 的Chelex-100,放入56℃保溫30分鐘以上。取出振蕩,100℃保溫8分鐘,振蕩,13000rpm離心3分鐘,上清用于PCR擴(kuò)增或放4℃保存?zhèn)溆谩?br />   5. 毛根
  用鑷子夾住毛發(fā)的根部,剪去其余部分,將毛根放入0.5ml離心管中(處理毛發(fā)時(shí)很容易遺失,應(yīng)小心操作,最好在桌面上鋪一張白紙。),加人純水洗一次,然后加入30μl 5%的Chelex-100和2μl 5mg/ml 的PK酶,放入56℃保溫6小時(shí)以上。取出振蕩,100℃保溫8分鐘,振蕩,13000rpm離心3分鐘,上清用于PCR擴(kuò)增或放4℃保存?zhèn)溆谩?br />   6. 肌肉與腦組織
   取小米粒大小的肌肉或腦組織,放入0.5ml離心管中,加人純水洗一次,然后加入200μl 5%的Chelex-100和 5μl 5mg/ml 的PK酶,放入56℃保溫3小時(shí)以上。取出振蕩,100℃保溫8分鐘,振蕩,13000rpm離心3分鐘,上清用于PCR擴(kuò)增或放4℃保存?zhèn)溆谩?/span>

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