Cooke (1976)首先報道了存在于人類Y染色體上的串聯(lián)重復(fù)序列，為人類遺傳學(xué)和法醫(yī)學(xué)的研究開辟了一條新的途徑。Roewer等(1992)發(fā)現(xiàn)了Y染色體上的第一個微衛(wèi)星DNA，重復(fù)單位為(GATA)。．現(xiàn)命名為DYS19。由于Y染色體多態(tài)性較低，且受當(dāng)時的技術(shù)限制，Y染色體多態(tài)性方面的研究進(jìn)展緩慢。至20世紀(jì)90年代初期，只有5個Y-STR基因座被詳細(xì)地描述，且只有DYS19被部分法醫(yī)學(xué)實驗室列入常規(guī)檢驗項目。近年來，隨著分子生物學(xué)技術(shù)的飛速發(fā)展，越來越多的Y-STR被開發(fā)和利用。Prinz等(1997)第一次建立了Y-STR復(fù)合擴(kuò)增體系，命名為Quadruplex I，分別用兩種熒光JOE和FAM標(biāo)記DYS19、DYS3891和DYS38911、DYS390，并做了法醫(yī)學(xué)應(yīng)用性研究。至2001年年底，研究者們在Y染色體上發(fā)現(xiàn)了大約30個STR基因座。Redd等 (2002)新開發(fā)了14個基因座，加上早已發(fā)現(xiàn)的基因座，分4個體系復(fù)合擴(kuò)增27個基因座，并進(jìn)行了群體遺傳學(xué)的研究。Butler (2003)建立了一個能夠同步擴(kuò)增20個Y-STR基因座的五色熒光復(fù)合擴(kuò)增體系，得到了較好的擴(kuò)增結(jié)果。至2006年，經(jīng)文獻(xiàn)報道有法醫(yī)學(xué)應(yīng)用價值的Y-STR基因座已有220個左右(Gus-mao et a1．，2006)。其中，歐洲Y染色體分型學(xué)會建立的“最小的單倍型” ( DYS19、DYS385alb、DYS3891、DYS38911、DYS390、DYS391、DYS392、DYS393)加上YCAII而成的“擴(kuò)展的單倍型”最常用，這些基因座已經(jīng)進(jìn)入了歐洲中央DNA數(shù)據(jù)庫。美國DNA分析方法技術(shù)工作組(Technique Working Group On DNA Analysis Method，TWGDAM)推薦的 “美國單倍型”由“歐洲最小單倍型”加上DYS438和DYS439紐成。至2007年3月，Y-STR單倍型數(shù)據(jù)庫中已經(jīng)包含了世界各地388個人群的46 831種最小單倍型。
      Y-STR的商品化檢測試劑盒也得到迅速發(fā)展。2003年，Reliagene公司分別推出了Y_PlexrM6系統(tǒng)(6-FAM和TAMRA兩種熒光標(biāo)記，含有DYS19、DYS385alb、DYS38911、DYS390、DYS391、DYS393)和Y_PlexTM5系統(tǒng)（6-FAM、TAMRA和HEX三種熒光標(biāo)記，含有DYS3891、DYS38911、DYS392、DYS438、DYS439)。同年，Promega公司推出了Powerplex Y系統(tǒng)(JOE、TAMRA和FI。三種熒光標(biāo)記，含有DYS19、DYS385a/b、DYS3891、DYS38911、DYS39C、DYS391、DYS92、DYS393、DYS437、DYS438、DYS439），該系統(tǒng)對多至lOOng的女性DNA無擴(kuò)增產(chǎn)物，靈敏度達(dá)0.Ing。在女性DNA 1000倍于男性DNA的情況下能夠成功擴(kuò)增出男性分型。2004年，Reliagene公司又推出了Y_PlexTM12泵統(tǒng)，在Y_PlexrM6系統(tǒng)和Y_Plexmo系統(tǒng)的基礎(chǔ)上引入Amelo-genin基因座作為PCR內(nèi)參照，最大限度地排除了假陰性，保證了結(jié)果的準(zhǔn)確性。同年，美國AB公司推出了AmpFISTR Y_FilerTM五色熒光復(fù)合擴(kuò)增系統(tǒng)，在一個反應(yīng)管內(nèi)可同步擴(kuò)增17個基因座（VIC、FAM、NED和PET四種熒光標(biāo)記，含有DYS19、DYS385a/b、DYS3891、DYS38911、DYS390、DYS391、DYS392、 DYS393、 DYS437、 DYS438、 DYS439、 DYS448、 DYS456、DYS458、Y-GATA-H4、DYS635)。該系統(tǒng)具有很高的特異性和靈敏度，對多至200ng的女性DNA無擴(kuò)增，在女性DNA 2000倍于男性DNA的情況下仍然能夠成功擴(kuò)增出男性分型。在我國，Y-STR復(fù)合擴(kuò)增系統(tǒng)的研究也取得了快速發(fā)展。趙東等(2003)利用聚丙烯酰胺凝膠電泳和銀染法復(fù)合擴(kuò)增了7個Y-STR (DYS393、DYS19、DYS390、DYS3891、DYS38911、DYS392、DYS385)，并對中國漢族和日本群體的Y-STR單倍型遺傳多態(tài)性及群體差異進(jìn)行了詞查。劉秋玲等(2004)采用三組復(fù)合擴(kuò)增的方法建立了12個Y-STR復(fù)合擴(kuò)增體系( DYS391、DYS3891、DYS389rl、Y-GATA-A4、Y-GATA-Al0、Y-GATA-H4、Y-GATA-A-10、DYS390、DYS393、DYS434、DYS437、DYS439)，以聚丙烯酰胺凝狡電泳和銀染法檢測并討論了其應(yīng)用價值。石美森等(2006)建立了一套四色熒光復(fù)合擴(kuò)增體系，設(shè)計了三套公共引物對分別嵌合在三組Y-STR的原始引物上，再利用6-FAM、HEX和TAMRA標(biāo)記的三組公共引物對同時復(fù)合擴(kuò)增7個Y-STR (DYS434、Y-GATA-A10、DYS531、DYS557、DYS448、DYS456、DYS444)，得到了良好的分型結(jié)果。