等位基因分型標(biāo)準(zhǔn)物是某- STR遺傳標(biāo)記在人群中常見的等位基因的混合物(Sajanti-la et a1.,1992)。它們和檢測(cè)樣本使用相同的引物,為每一個(gè)等位基因提供DNA片段大小參照物。等位基因ladder對(duì)精確地基因型分型十分重要(Smith,1995)。這些ladder就像一個(gè)量尺,是檢測(cè)每一個(gè)SIR基因座的標(biāo)準(zhǔn),它是對(duì)不同實(shí)驗(yàn)室因儀器和條件不同檢測(cè)到的不同片段進(jìn)行校正的必要保證。
DNA親子鑒定之等位基因分型標(biāo)準(zhǔn)物( Allelic ladders)
2020-11-04 22:36:17 來源: 法醫(yī)物證學(xué)
ladder是由基因組DNA或人群中多個(gè)個(gè)體的基因座特異性PCR產(chǎn)物聯(lián)合構(gòu)建,其中含有特定STR遺傳標(biāo)記的所有等位基因(Sajantila et a1.,1992; BaechtPI et al.;1993)。這些樣本一起擴(kuò)增,產(chǎn)生一個(gè)人為樣本,其中包含STR遺傳標(biāo)記的常見等位基因。通過調(diào)整每種組分的加入量來平衡各等位基因的含量,以保證ladder中各種等位基因的量的平衡。如產(chǎn)生一個(gè)五等位基因6 \7.8.9、10次重復(fù)的ladder,可聯(lián)合使用分型為(6/8)、(7/10)、 (9/9)白勺樣本。還可以是(6/9)、(7/8)、(10110)或(6/6)、(7/7)、(8/8)、(9/9)、(10110)的組合。
為獲得更多的ladder(二代和三代ladder),可以簡(jiǎn)單地用去離子水稀釋原始ladder到l/1 000 000~1/1000后,重新使用相同的PCR引物擴(kuò)增(Baechtel et al.,1993)。必須使用與擴(kuò)增未知樣本相同的PCR引物合成ladder,保證未知樣本與ladder比較時(shí),可精確獲得未知樣本的重復(fù)次數(shù)。如下所述,商業(yè)試劑公司提供STR分型試劑金的ladder,實(shí)驗(yàn)室無需自己制作。
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